六级伤残仍在公司上班的处理中，存在以下特殊情况会影响待遇：
1. 伤残等级发生变化：若后续您的伤残情况加重（如因工伤复发导致功能进一步丧失），经劳动能力鉴定委员会重新鉴定为五级伤残，公司需将伤残津贴调整为本人工资的70%，同时一次性伤残补助金的差额部分需重新核算，待遇标准会显著提高。
2. 公司未缴纳工伤保险：若公司未为您缴纳工伤保险，所有待遇（一次性伤残补助金、伤残津贴等）均需由公司自行承担，而非从工伤保险基金支付；若公司拒绝支付，您需通过劳动仲裁或诉讼向公司主张，维权流程更长。
3. 您主动提出解除劳动关系：若您因身体原因主动辞职，可额外领取一次性工伤医疗补助金（社保基金付）和一次性伤残就业补助金（公司付），但需注意不同省份的标准差异（如部分省份规定“距退休年龄不足5年的，补助金逐年递减”）。
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六级伤残仍在公司上班时，部分职工可能因对政策不熟悉出现错误操作，以下是常见情形：
1. 未及时申领一次性伤残补助金：部分职工误以为“继续上班就不能领一次性伤残补助金”，导致超过1年申请时效（自伤残鉴定之日起算），无法再从工伤保险基金获得该笔补偿。
2. 接受公司不合理降薪：若公司安排了适当工作，却以“伤残影响效率”为由降低原工资待遇，职工未提出异议，可能长期损失合法劳动报酬。
3. 忽视伤残津贴的社保缴纳义务：若公司难以安排工作却仅发伤残津贴、不缴纳社保，职工未及时维权，会导致养老、医疗等社保权益受损。
若您已出现上述错误操作，或不确定自身权益是否被侵害，建议立即联系律师，及时采取补救措施。
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六级伤残仍在公司上班期间，可能存在以下法律风险：
1. 伤残津贴支付中断风险：例如，公司因经营困难或故意拖欠，停止发放伤残津贴（如您因伤残无法从事原岗位，公司又未安排其他工作，却突然停发津贴），导致您失去稳定收入来源，需通过仲裁或诉讼维权，耗时耗力。
2. 社保缴纳缺失风险：例如，公司仅发伤残津贴却未按规定缴纳社保（如未缴医疗保险），您后续因工伤复发就医时，可能无法享受医保报销，需自行承担高额医疗费用。
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工伤鉴定为六级伤残仍在公司上班时，您可依法享受相应的工伤保险待遇。
您可享受的待遇需结合公司是否安排工作的情况确定：
1. 若公司为您安排了适当工作：您有权领取原工资待遇，同时可从工伤保险基金获得一次性伤残补助金（16个月本人工资）。
2. 若公司难以安排工作：公司需按月向您支付伤残津贴（本人工资的60%），且需为您缴纳各项社会保险费；若伤残津贴低于当地最低工资标准，由公司补足差额。
3. 若您后续主动提出解除劳动关系：可额外领取工伤保险基金支付的一次性工伤医疗补助金，以及公司支付的一次性伤残就业补助金（具体标准依省级政府规定）。

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